Desain Rasional Penemuan Obat Baru: Pendekatan Molekular Doking dan Simulasi Molekular Dinamik, Analisis QSAR, Serta Green Chemistry

Dalam proses penemuan senyawa obat baru, baik melalui proses sintesis, semi sintesis maupun ekstraksi danisolasi bahan alam, metode uji in vitro dan in vivo lazim digunakan untuk menganalisis aktivitas biologis calon obat. Kedua metode tersebut memiliki konsekuensi biaya, waktu dan tenaga yang cukup besar untuk dilakukan. Komputer menawarkan metode in silico, suatu metode yang menggunakan kemampuan komputer dalam rancang obat sebagai komplemen kedua metode uji aktivitas tersebut. Teknik komputasi berkembang secara drastis pada dua dekade ini termasuk kemajuan yang revolusioner dalam bidang perangkat lunak , perangkat keras, dan Artificial Intelligence (AI). Dengan kemajuan teknologi tersebut, peneliti dapat memprediksi aktivitas, susunan geometri dan reaktivitas senyawa sebelum diuji atau disintesis secara eksperimental, sehingga waktu dan biaya riset dapat direduksi. Dua metode rancangan obat yang menggunakan kimia komputasi (in silico) yaitu, 1. Metode yang didasarkan pada senyawa yang diketahui berikatan dengan target atau biasa disebut ligan dan metode yang didasarkan pada struktur target baik berupa enzim maupun reseptor yang bertanggung jawab atas aktivitas dan toksisitas suatu senyawa di dalam tubuh.
Pendekatan ekperimental pada eksplorasi senyawa kandidat obat dapat dilakukan dengan menggunakan prinsip green chemistry, atau kimia ramah lingkungan. Hal ini penting untuk memastikan bahwa proses sintesis obat baru dilakukan dengan cara/proses yang berkelanjutan. Prinsip green chemistry bertujuan untuk meminimalkan penggunaan bahan berbahaya, mengurangi limbah, efisiensi atom dan meningkatkan efisiensi energi dalam proses kimia.
Dalam pemanfaatan teknologi komputasi untuk rancang obat dan mencapai tujuan green chemistry, sangat penting disusun langkah langkah strategis, efektif, sistematis dan rasional dalam proses penemuan senyawa obat baru.